下列案件，认系属重大黑金案件。（一） 贪渎案件：“中央部会”以上官员、司法官所涉贪渎案件；“中央民意代表”、直辖市市长、副市长、县市长、副县市长或议长、副议长、乡镇市长、乡镇市民代表会正、副主席所涉之贪渎案件；其他公务员或民意代表所涉之重大贪渎案件。

　　（二） 重大暴力案件：有组织性之集团犯罪案件。

　　（三） 重大妨害选举案件。

　　（四）重大经济犯罪案件。

　　（五）重大环保犯罪案件。

　　（六）其他严重侵害“国家”法益或影响社会治安之案件。

　　（2007年4月2日废止）

　　台湾“高等法院检察署黑金行动中心”在成立一周年前夕的新闻稿中表示：鉴于黑金问题严重，不仅腐蚀“国家”根基，更使民众对政府失去信心，陈水扁于2000年5月20日就职演说中即宣示“扫除黑金”为新政府成立后施政的首要目标，“法务部”亦将此列为第一优先政策……就“扫黑、肃贪、查贿”等方面的重大犯罪予以查缉。

　　从2006年2月3日修改法院组织法，增订第63－1条特侦组制度：“最高法院检察署”设特别侦查组，职司下列案件：一、涉及“总统”、“副总统”、“五院院长”、“部会首长”或“上将”阶军职人员的贪渎案件；二、选务机关、政党或候选人于“总统”、“副总统”或“立法委员”选举时，涉嫌“全国性”舞弊事件或妨害选举的案件；三、特殊重大贪渎、经济犯罪、危害社会秩序，经“最高法院检察署检察总长”指定的案件。